我國(guó)首次成功破譯2種棕櫚藤基因組信息
人民網(wǎng)北京12月29日電 (施麟)29日,竹藤基因組學(xué)學(xué)術(shù)成果發(fā)布會(huì)在北京舉行。會(huì)上獲悉,繼2013年發(fā)布了首個(gè)竹亞科的全基因組――毛竹全基因組數(shù)據(jù)之后,2018年國(guó)際竹藤中心又首次成功破解了2種棕櫚藤的全基因組。會(huì)上還發(fā)布了最新毛竹高精度基因組數(shù)據(jù)。
國(guó)際竹藤中心主任江澤慧指出,在科技部、國(guó)家林業(yè)和草原局和國(guó)際竹藤中心等單位領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)心指導(dǎo)下,在竹藤科研工作者的不懈努力下,國(guó)際竹藤中心發(fā)起并積極推動(dòng)全球竹藤基因組計(jì)劃,歷經(jīng)5年的刻苦攻關(guān),作為全球竹藤基因組計(jì)劃的初期成果,今天,我們終于在世界上首次破譯2種棕櫚藤(即黃藤和單葉省藤)的全基因組信息,并持續(xù)維護(hù)、完善毛竹基因組到高精度的染色體水平。這些科研成果標(biāo)志著我國(guó)竹藤分子生物學(xué)基礎(chǔ)研究取得了進(jìn)一步的重大突破。
基因組數(shù)據(jù)作為重要的生物學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù),在推動(dòng)竹藤基礎(chǔ)科學(xué)研究方面發(fā)揮著重要的作用。預(yù)計(jì)到2019年,還將完成3-5個(gè)竹種和2-3個(gè)棕櫚藤藤種的全基因組測(cè)序和組裝工作。在2020年左右,國(guó)際竹藤中心將發(fā)布和維護(hù)累計(jì)10個(gè)以上的竹藤基因組數(shù)據(jù)。
國(guó)家林業(yè)和草原局副局長(zhǎng)彭有冬表示,繼2013年我國(guó)首次發(fā)表“毛竹全基因組草圖”,填補(bǔ)了世界竹類(lèi)基因組學(xué)研究空白以來(lái),歷經(jīng)5年聯(lián)合攻關(guān),在世界上首次破譯棕櫚藤的全基因組信息,并將毛竹基因組更新到高精度的染色體水平。特別是一次獲得了2個(gè)高精度的棕櫚藤的全基因組數(shù)據(jù),成果2018年在世界權(quán)威基因組學(xué)雜志《大數(shù)據(jù)》上發(fā)表,填補(bǔ)了棕櫚藤植物基因組信息的空白,對(duì)于我們深入開(kāi)展棕櫚藤植物的功能基因組學(xué)、比較基因組學(xué)研究具有重大的科學(xué)價(jià)值,對(duì)于全球棕櫚藤未來(lái)的基因科技產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)具有深遠(yuǎn)的歷史意義。
2016年,由國(guó)際竹藤中心,深圳華大生命科學(xué)研究院等單位共同發(fā)起,多個(gè)國(guó)家相關(guān)科研單位或大學(xué)共同參與的全球竹藤基因組計(jì)劃 (GABR)正式發(fā)布。本計(jì)劃分為竹子和棕櫚藤兩個(gè)分計(jì)劃。整個(gè)計(jì)劃旨在收集全球代表性竹藤樣品,從組學(xué)角度回答,“竹藤?gòu)暮味鴣?lái),如何演化,如何發(fā)展?”等問(wèn)題,這也是竹藤生物演化研究中最基礎(chǔ)的科學(xué)問(wèn)題。大規(guī)模基因組數(shù)據(jù)的應(yīng)用使得物種的演化歷程得以重現(xiàn),回答這些最根本的科學(xué)問(wèn)題。同時(shí),這是迄今為止對(duì)竹藤兩物種最大規(guī)模的基因組演化歷程分析,也是利用比較基因組學(xué)揭示生物宏觀演化歷史的重要一步。
據(jù)了解,棕櫚藤是熱帶和南亞熱帶森林寶庫(kù)中的多用途非木本植物資源,原藤是僅次于木材和竹材的重要林產(chǎn)品,具有重要的生態(tài)和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。全球每年藤工業(yè)產(chǎn)值約為70億美元。單葉省藤和黃藤兩個(gè)染色體水平的全基因組測(cè)序工作的完成,填補(bǔ)了世界棕櫚藤基因組學(xué)研究空白,也標(biāo)志著我國(guó)棕櫚藤生物學(xué)基礎(chǔ)研究取得了重大突破。
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